白瓜子最早见于《本经》：“ 一名水芝”。《名医别录》：“ 一名白爪 （侧绞切）子。” 川古代医家对白瓜子名称的认识主要有二种：一是甘瓜子，即甜瓜子；二是冬瓜仁。认为白瓜子为甜瓜子者，出于《唐·新修本草》。《唐本草》曰：“ 经云 （ 白瓜子）冬瓜仁也。八月采之，已下为冬瓜仁说，非谓冬瓜别名。据经及下条“瓜蒂”并生离平地，此即一物。但以一似自宇，后人误 以为白也。且朱书论白瓜之效，墨书说冬瓜之功，功异条同。别录云：“甘瓜子主腹内结聚，破溃脓血，最为肠胃脾之内奎之要药。诸本草以为冬瓜，但用蒂不云子也。今肠痈汤用之，俗人或用冬瓜子，非也 ”。因此，《唐本草》 做出结论：“ 诸本草云瓜子或云白瓜子，今此本误作白，当改从一甘也。”以上苏恭所论似有道理，但理由未免牵强，以致不为后卜世医家所循，纷纷提出质疑。

多数医家则认为白瓜子为冬瓜子。例如，《名医别录》：“ 一名水爪 （ 侧纹切 ） 子，生高高平地，冬瓜人也”。《开宝本草》亦认为白瓜子就是冬瓜仁，并批驳了苏恭的：“ 白瓜子为 甘瓜子” 之论的荒谬不可为凭。并 以 《本经》“ 主令人悦泽” 、《别录》“ 可做而脂令人悦泽，而历代面脂方中多用冬瓜仁，不见自瓜子” 等记载作为依据，断定白瓜子“ 即冬瓜子 明矣。”

强调自瓜子之名的由来，其白非言瓜之自，而言子之色。《开宝本草》 又云：“ 甘瓜有青白两种，子色皆黄，主疗与白瓜有异，而冬瓜皮虽青，经霜亦有白衣，其中子白，白瓜子之号因斯而得”。并引证《别录》所载，将 白冬瓜附于白瓜子之下。山此得 出结论：“ 白瓜子乃冬瓜仁也 ”这似乎较《唐本草》更为可信。因此，后世诸多本草学家都认可《开宝本草》所述。

《嘉裙本草》与《开宝本草》的观点儿乎完全相同。它又用一个例证恰当她论证了自己的观点：“ 冬瓜虽色青而其中子甚白，谓如自瓜者，犹如虫部有白龙骨焉，人但看骨之白，而不知龙之色也。”强调了《开宝本草》之观点：白瓜子之名称由来，其白非言瓜之白而言子之色也。

《木华品汇精要》对 自瓜子的论述较为客观：“ 白瓜子肋亩条冬瓜子冬瓜皮虽青，经藉赤白，其中子方正洁 白，比次整齐，非他子形色之可 比也。故谓之白瓜子另外《全国重名易混中药鉴别手册》所录南瓜子项下有异名“ 白瓜 子”，可见，历代自瓜子之名的使用是何等混乱。